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實(shí)驗(yàn)室常規(guī)熒光蛋白的介紹

來源:上海儀橙科技有限公司   2025年06月06日 10:03  

以下內(nèi)容為上海儀橙科技對熒光蛋白激發(fā),起源,用途的整理匯總,內(nèi)容來自網(wǎng)絡(luò),僅供各位寶寶參考:

在光譜的綠光區(qū)(500nm-525nm)已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了多種熒光蛋白,而且來源廣泛,包括不同種屬的Aequorea 、橈足類動物、文昌魚以及珊瑚。然而多數(shù)有齊聚反應(yīng),即使好的熒光蛋白與EGFP相比,也沒有明顯的優(yōu)點(diǎn)?;蛟S目前活細(xì)胞成像好的選擇是GFP衍生的Emerald(祖母綠),它與EGFP的特性相似。Emerald包含F64LS65T突變,另外還有四個(gè)點(diǎn)突變從而改進(jìn)了折疊、37℃時(shí)的突變率以及亮度。雖然EmeraldEGFP更有效,但含有快速光漂白成分,可能在某些環(huán)境下其定量成像會受到影響。

熒光蛋白的發(fā)現(xiàn)改變了生命科學(xué)研究。它像一盞"分子燈",讓科學(xué)家能直接觀察細(xì)胞內(nèi)基因活動、蛋白質(zhì)互作等原本看不見的過程。綠色熒光蛋白(GFP)在經(jīng)過改良后變得更亮更穩(wěn)定,又衍生出紅、藍(lán)、黃等不同顏色的熒光蛋白,甚至能隨環(huán)境變化或光照改變發(fā)光的狀態(tài),得以滿足多色標(biāo)記、深層組織成像等需求。現(xiàn)在的市場上新型熒光蛋白的理化特性(如亮度提升、光穩(wěn)定性優(yōu)化、光譜紅移等)為突破成像技術(shù)的物理極限提供物質(zhì)基礎(chǔ);而先進(jìn)技術(shù)的應(yīng)用需求(如多色同步追蹤、深層組織成像)又反向推動熒光蛋白的定向改造與功能創(chuàng)新持續(xù)拓展著生命科學(xué)的認(rèn)知邊界。

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下面主要介紹GFP及其衍生型熒光蛋白:

1、綠色熒光蛋白(green fluorescent protein,GFP

1)來源

19世紀(jì)70年代下村修成功純化了這種發(fā)光的蛋白質(zhì),并且命名為水母素多年以后,下村修隔壁的一位科學(xué)家道格拉斯普瑞舍Douglas C. Prasher)從水母中成功克隆了GFP的基因序列,也想讓GFP在生物體內(nèi)發(fā)光,但是卻沒有成功。不過這位科學(xué)家離開的時(shí)候他將提取到的基因序列贈予了許多對GFP感興趣的實(shí)驗(yàn)室。1994年馬丁查菲實(shí)驗(yàn)室的研究生吉亞·奧伊斯基興(Ghia Euskirchen)把GFP的基因序列轉(zhuǎn)入了大腸桿菌和線蟲中,成功看到了綠色熒光。這一發(fā)現(xiàn)證明了GFP能夠和其他蛋白在細(xì)胞內(nèi)融合表達(dá)并且不需要熒光素這樣的分子輔助就可以發(fā)出熒光??茖W(xué)家們通過熒光就可定位其融合的蛋白,研究蛋白質(zhì)在活細(xì)胞中的定位和功能。

2)性質(zhì)

GFP238個(gè)氨基酸殘基組成。GFP序列中的65-67位殘基(Ser65-Tyr66-Gly67)可自發(fā)形成熒光發(fā)色基團(tuán)——對羥基苯咪唑啉酮GFP的激發(fā)光譜在400nm附近有一個(gè)主激發(fā)峰,在470nm附近有一個(gè)次激發(fā)峰。發(fā)射光譜在505nm附近有一尖銳的主發(fā)射峰,在540nm附近有一肩峰GFP的化學(xué)性質(zhì)相當(dāng)穩(wěn)定,無光漂白現(xiàn)象(Photobleaching),用甲醛固定和石蠟包埋亦不影響其熒光性質(zhì)。在細(xì)胞生物學(xué)與分子生物學(xué)領(lǐng)域中,綠色熒光蛋白基因常被用作報(bào)告基因。

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3)野生型

野生型GFPwild type GFP, wtGFP)從一開始就引起了人們極大的興趣,而且被用作新型的簡單報(bào)告基因及體內(nèi)標(biāo)記,但GFP在異源生物體中的表達(dá)并非那么簡單。例如,研究人員很早就發(fā)現(xiàn)需要在較高的溫度下孵育才能在細(xì)胞或生物體中表達(dá)GFP,并且wtGFP37℃的熱穩(wěn)定性差。這些都阻礙了它在轉(zhuǎn)基因中的應(yīng)用。這些難題促使人們進(jìn)一步篩選分離wtGFP的變體。現(xiàn)在,人們已經(jīng)找到了熒光強(qiáng)度更強(qiáng)且更耐熱的變體。這些變體多數(shù)為經(jīng)突變的脫輔基蛋白,它們可防止高溫導(dǎo)致的錯(cuò)誤折疊。近年來出現(xiàn)的新型wtGFP基因突變體的激發(fā)和發(fā)射譜發(fā)生了改變,熱穩(wěn)定性和熒光強(qiáng)度得到了提高,GFP報(bào)告基因在小鼠中的應(yīng)用就是以這些變體作為基礎(chǔ)的。

4)增強(qiáng)型綠色熒光蛋白(EGFP

現(xiàn)在,應(yīng)用最為廣泛的是紅移變體增強(qiáng)型GFPEGFP)。諸如EGFP這些紅移變體的最大激發(fā)峰發(fā)生紅向移動,大約為490nm,這一波長也恰好是多數(shù)分光設(shè)備、流式細(xì)胞儀及共聚焦顯微鏡的常用波長。EGFP有兩個(gè)氨基酸突變,當(dāng)被藍(lán)光激發(fā)時(shí),它發(fā)出的熒光要比wtGFP30-40倍。wtGFP和包括EGFP在內(nèi)的多數(shù)變體半衰期長,所以不適合精確追蹤表達(dá)的減少或損耗。

5)增強(qiáng)型黃色熒光蛋白(EYFP

另一種紅移變體是增強(qiáng)型黃色熒光蛋白(EYFP),該變體有四個(gè)氨基酸突變。在527nm時(shí),EYFP的發(fā)射光從綠色變?yōu)辄S綠色。EYFP熒光的亮度水平與EGFP相當(dāng)。EYFP 抗酸性差、對鹵化物敏感,使它的應(yīng)用受到限制。在EYFP 基礎(chǔ)上改進(jìn)的突變體mCitrine[21]mVenus[22]是目前應(yīng)用最多的黃色熒光蛋白。

6)增強(qiáng)型藍(lán)色熒光蛋白(EBFP

在光譜的另一端是藍(lán)色/藍(lán)綠色變體,包括增強(qiáng)型藍(lán)色熒光蛋白(EBFP)變體。它有四個(gè)氨基酸突變,激發(fā)波長和發(fā)射波長分別為380nm-405nm440nm。由于這些突變改進(jìn)了蛋白折疊和發(fā)色團(tuán)形成的效率,所以也增強(qiáng)了所發(fā)出熒光的亮度(與藍(lán)色變體相比)和蛋白溶解性。但不足之處,就是EBFP產(chǎn)生的熒光信號 大致與wtGFP相當(dāng)。藍(lán)色熒光蛋白發(fā)光較弱,抗光漂白和抗酸性較差,用于細(xì)胞成像時(shí)背景信號高。針對EBFP開發(fā)的3個(gè)更亮的突變體:Azurite (亮度是EBFP1.6 )、EBFP2(亮度是EBFP2倍,mTagBFP(亮度是EBFP3.7)。最亮的藍(lán)色熒光蛋白。mTagBFP 是由紅色熒光蛋白TagRFP突變而來。

7)增強(qiáng)型藍(lán)綠色(青色)熒光蛋白(ECFP

增強(qiáng)型藍(lán)綠色熒光蛋白(ECFP)是發(fā)出藍(lán)色/藍(lán)綠色熒光的另一種變體,產(chǎn)生的熒光信號要比wtGFP強(qiáng)。ECFP有六個(gè)氨基酸突變,發(fā)射光譜從綠色遷移到藍(lán)綠色,最大激波長在433nm(主峰)和453nm(次峰),最大發(fā)射在475nm,于510nm處有一肩峰,ECFP另一特點(diǎn)是比其它藍(lán)色/藍(lán)綠色變體光漂白效應(yīng)弱,而且比EBFP的亮度強(qiáng)。值得一提的是,wtGFP的主要綠色熒光變體,如EGFP等已經(jīng)在ES細(xì)胞、基因打靶和轉(zhuǎn)基因小鼠研究中得到充分應(yīng)用。

2、藍(lán)色及藍(lán)綠色熒光蛋白多數(shù)用于亞細(xì)胞地位,信號強(qiáng)度高)

雖然EBFPBFPAequorea GFP來源的最早的光譜變體之一,但其亮度低、光穩(wěn)定性差,使其很久以來沒有引起多數(shù)研究者的注意。改進(jìn)的藍(lán)色Aequorea 熒光蛋白變體與EBFP相比,亮度和光敏感性有明顯增強(qiáng)。這些新的變體被命名為Azurite(石青或藍(lán)銅礦)、強(qiáng)力增強(qiáng)型藍(lán)色熒光蛋白2strongly enhanced blue fluorescent protein 2, SBFP2)及EBFP2,它們第一次使得活細(xì)胞在藍(lán)色光譜區(qū)域成功地長時(shí)間成像成為可能。即使這三種熒光蛋白在高濃度的微環(huán)境中表現(xiàn)出很弱的二聚體特性,但是它們能夠在與亞細(xì)胞定位的靶蛋白融合中有效地發(fā)揮作用,并且它們能夠很容易地通過濾光片設(shè)備與標(biāo)準(zhǔn)的BFP4', 6-二脒基-2-苯基吲哚(4',6-diamidino-2-phenylindole, DAPI)一起成像。所有這些BFP變體都可以通過A206K突變改造成真正的單體,而且這種突變不會影響它們的特性。更重要的是,亮度強(qiáng)、光穩(wěn)定性強(qiáng)的藍(lán)色熒光蛋白EBFP2,是EGFP在活細(xì)胞中FRET的很好的供體。

3、黃色熒光蛋白

熒光蛋白的改造遵循這樣一個(gè)宗旨,那就是越紅越好.普遍認(rèn)為,長波長光子的激發(fā)對細(xì)胞和組織的光毒性小,且自體熒光和動物組織的光吸收都是最小。這些因素意味著紅色的熒光基團(tuán)對比度提高(因?yàn)楸尘皯?yīng)該降低),且更適合于體內(nèi)成像。于是,熒光蛋白的改造慢慢向紅色偏移。

黃色熒光蛋白最早的變體EYFP雖然仍被廣泛應(yīng)用,但由于其pK a值高、對鹵化物敏感,導(dǎo)致EYFP的應(yīng)用還很不理想。單體形式的變體檸檬黃(mCitrine)和維納斯(mVenus)是目前應(yīng)用最多的黃色熒光蛋白探針。

另一種很有應(yīng)用潛力的黃色熒光蛋白是能量轉(zhuǎn)移黃色熒光蛋白(yellow fluorescent protein for energy transfer, YPet),它經(jīng)合成的DNA重排獲得,與熒光激活的細(xì)胞分選術(shù)結(jié)合能夠增強(qiáng)FRET中藍(lán)綠色熒光蛋白和黃色熒光蛋白的配對。YPet是已經(jīng)開發(fā)的亮度強(qiáng)的黃色熒光蛋白,并且有很好的光穩(wěn)定性。YPet對酸性環(huán)境的耐受性要比mVenus及其它黃色熒光蛋白變體強(qiáng)。

4、橙色熒光蛋白

在橙色和紅色波長(約560nm650nm)光譜區(qū)僅僅開發(fā)了幾種探針。盡管如此,現(xiàn)有的這幾種光譜型的蛋白都是從珊瑚中分離得到的,并且在多種成像情景中顯現(xiàn)出應(yīng)用潛力,但在對橙色區(qū)域熒光蛋白的命名中存在混亂。通常被命名為紅色熒光蛋白視覺效果像櫻桃紅)RFP的探針如DsRed、TagRFPtdTomato,實(shí)際上具有明顯的橙色多于紅色的發(fā)射譜。不考慮顏色的指示,用標(biāo)準(zhǔn)的四甲基羅丹明異硫氰酸脂(tetramethyl-rhodamine isothiocyanate, TRITC)濾光片設(shè)備,橙色光譜型的蛋白在多種顏色如藍(lán)綠色、綠色和紅色情景中更易于成像。

5、紅色熒光蛋白

紅色熒光蛋白(drFP583 )在克隆的綠色熒光蛋白(GFP)的基礎(chǔ)上改造的,并在此基礎(chǔ)上進(jìn)行了大量的研究和改造。通過對GFP進(jìn)行基因突變和定向誘變技術(shù),科學(xué)家們成功開發(fā)出了幾種變體,其中之一就是紅色熒光蛋白(RFP,在綠色光源595-600nm的照射下可發(fā)射紅色熒光,因此,人們對它進(jìn)行了一系列修飾和改進(jìn),得到了寡聚化程度低(甚至單體)和成熟速率快的突變體,商業(yè)化命名為DsRed。與GFP相比,DsRed的激發(fā)和發(fā)射波長較長,其發(fā)射峰位于培養(yǎng)基、組織培養(yǎng)器材及細(xì)胞成分等產(chǎn)生的熒光背景范圍之外,具有較高的信噪比;而且在細(xì)胞內(nèi)熒光轉(zhuǎn)換效率高,更易檢測。較早報(bào)道的紅色熒光蛋白(DsRed) 的突變體有mBanana、mOrangedTomato、mTangerinemStrawberry mCherry。

在活細(xì)胞及動物全身成像中需要表現(xiàn)較好的紅色熒光蛋白,主要是由于在多種顏色成像實(shí)驗(yàn)中需要紅色探針,另外基于較長的激發(fā)波長產(chǎn)生的光毒性較小,可以用來探測較深的生物組織。最新研究進(jìn)展是,通過mRFP1發(fā)色團(tuán)殘基的直接突變產(chǎn)生的新的熒光蛋白,得到的單體熒光蛋白發(fā)射峰在560nm610nm,并以相應(yīng)的水果名字來命名。這其中mStrawberrymCherry,發(fā)射峰分別為596nm610nm,亮度分別為EGFP75%50%左右。mCherry的光穩(wěn)定性要遠(yuǎn)強(qiáng)于mStrawberry,所以長期成為成像實(shí)驗(yàn)中mRFP1好的替代品。這些以水果命名的熒光蛋白單體與mKOTagRFP共同補(bǔ)了水母紅移熒光蛋白(如YPet)與大量低聚紅色珊瑚熒光蛋白間的空白,并且目前已經(jīng)商業(yè)化。雖然,某些熒光蛋白缺乏許多成像實(shí)驗(yàn)所需要的亮度和光穩(wěn)定性,但是它們的存在提示我們,最終可以找到跨越整個(gè)可見光譜的亮度高、穩(wěn)定性強(qiáng)的單體探針。

6、熒光蛋白突變體

熒光素和熒光素酶

1螢火蟲熒光素酶

目前常用的螢火蟲熒光素酶來源于北美螢火蟲(Photinuspyralis),是一個(gè)61kDa的單體酶,無需表達(dá)后修飾,直接具有全酶活,反應(yīng)需要底物熒光素以及ATP、O2Mg2+等的參與。

2海腎熒光素酶

海腎熒光素酶來源于海腎(Renillareniformis),是一個(gè)36kDa的單體酶,表達(dá)后無需修飾,即可具有全酶活。反應(yīng)只需要腔腸素(Coelenterazine)和O2參與。

3Gussia熒光素酶

Gussia熒光素酶來源于夏威夷水域的一種大型海洋溡腳類動物Gaussiaprinceps,是一個(gè)19.9kDa的單體酶,只有185個(gè)氨基酸,具有一個(gè)16aa的分泌性信號肽,可以被細(xì)胞分泌到細(xì)胞外,可以引導(dǎo)熒光素酶分泌到細(xì)胞培養(yǎng)上清中,從而無需裂解細(xì)胞即可檢測報(bào)告基因活性

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