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微生物鑒定儀鑒定原理：碳源利用原理，利用微生物對不同碳源代謝率的差異，通過檢測微生物細胞利用不同碳源進行新陳代謝過程中產(chǎn)生的NADH與顯色物質(zhì)發(fā)生反應而導致的顏色變化，與標準數(shù)據(jù)庫進行比對，即可得出最終鑒定結(jié)果。主機由可控溫度培養(yǎng)室及程控圖形捕獲系統(tǒng)部分構(gòu)成，計算機內(nèi)圖形捕獲卡通過主機中的攝像頭攝取微孔板底部的圖片，由軟件對每個微孔中的顏色進行數(shù)字化分析，軟件自動判定結(jié)果。
數(shù)據(jù)庫容量大于2900種(taxa)，包含四大類數(shù)據(jù)庫，其中Gen III好氧細菌數(shù)據(jù)庫1568種（革蘭氏陰性好氧菌800種，革蘭氏陽性好氧菌768種），其它可選數(shù)據(jù)庫有：厭氧菌361種，酵母菌267種，絲狀真菌710種。幾乎涵蓋了所有常見的人類、動物、植物病原菌以及食品、藥品和環(huán)境微生物。
絲狀真菌數(shù)據(jù)庫（FF），可自動鑒定包括臨床、工業(yè)、農(nóng)業(yè)及環(huán)境中常見青霉（153種）、曲霉（89種）、刺盤孢霉（18種）、鐮刀霉（79種）、木霉及其它種等708種絲狀真菌。為與傳統(tǒng)的真菌形態(tài)學鑒定相結(jié)合，BIOLOG提供近1000多張精美的宏觀和顯微圖片供用戶參考比對，以獲得更為精確的結(jié)果。
在食品、化妝品和制藥工業(yè)領域提供大量的常見致病菌數(shù)據(jù)庫，包括沙門氏菌（15種）、李斯特菌（7種）、大腸桿菌（8種，含阪崎腸桿菌和E.coli O157:H7）、葡萄球菌（43種好氧，2種厭氧）、彎曲菌、假單孢菌（52種）、弧菌（23種）、梭菌（60種）、志賀氏菌（4種）、耶爾森氏菌（11種）、鏈球菌（61種，含豬鏈球菌）、金黃桿菌屬（32種）等，用于食品、藥品及化妝品行業(yè)致病微生物鑒定儀、工業(yè)應用微生物研究、質(zhì)量控制及產(chǎn)品研發(fā)等。
在植物病原菌鑒定方面，可鑒定常見的植物病原菌達到258種，如假單孢菌 （130種），伯克霍爾德菌（13種）、黃單孢菌 屬（81種）、果膠桿菌屬（14種）、食酸菌屬 （7種）、短小桿菌（5種）、根瘤菌屬（4 種）、歐文氏解淀粉菌等，數(shù)百種植物致病細菌及數(shù)百種的植物病原真菌。
可鑒定23種分枝桿菌(Mycobacterium)。
可鑒定放線桿菌共22種，其中革蘭氏陽性好氧放線菌8種，厭氧放線菌14種。
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