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PEG在核酸提取中的具體應(yīng)用

閱讀:1036      發(fā)布時(shí)間:2024-10-21
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一、PEG是什么?

     PEG,聚乙二醇是一種高分子聚合物,無刺激性,味微苦,具有良好的水溶性,并與許多有機(jī)物組分有良好的相溶性。具有優(yōu)良的潤滑性、保濕性、分散性、粘接性,可作為抗靜電劑及柔軟劑等使用,在化妝品、制藥、化纖、橡膠、塑料、造紙、油漆、電鍍、農(nóng)藥、金屬加工及食品加工等行業(yè)中均有極為廣泛的應(yīng)用。其分子式為HO(CH2CH2O)nH,其中n代表聚合度,決定了PEG的分子量。PEG具有良好的水溶性、無毒性、生物相容性和化學(xué)穩(wěn)定性,這些特性使得PEG在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域得到了廣泛應(yīng)用。

二、PEG在核酸提取中的作用機(jī)制

1、促進(jìn)核酸凝聚

     PEG在核酸提取中的主要作用之一是促進(jìn)核酸的凝聚。在高鹽濃度(如NaCl)存在下,PEG能夠與核酸分子相互作用,使核酸從水化的線狀構(gòu)象轉(zhuǎn)變?yōu)榫o湊的球狀構(gòu)象。這種構(gòu)象轉(zhuǎn)變暴露出核酸分子表面的負(fù)電荷磷酸基團(tuán),增加了核酸分子之間的靜電相互作用,從而促進(jìn)核酸的凝聚和沉淀。

2、增強(qiáng)核酸與固相載體的結(jié)合

     在核酸提取過程中,常常使用磁珠、硅膠等固相載體來吸附和純化核酸。PEG的加入能夠增強(qiáng)核酸分子與固相載體之間的結(jié)合力。具體來說,PEG能夠通過與核酸分子表面的負(fù)電荷磷酸基團(tuán)和固相載體表面的正電荷基團(tuán)(如氨基)形成離子橋,從而牢固地將核酸分子吸附在固相載體上。

3、減少非特異性吸附

     在核酸提取過程中,除了目標(biāo)核酸分子外,還常常存在許多非特異性成分(如蛋白質(zhì)、多糖等)。這些非特異性成分可能會(huì)與固相載體結(jié)合,影響核酸的純化效果。PEG的加入能夠在一定程度上減少這些非特異性成分與固相載體的結(jié)合,提高核酸提取的純度。

4、沉淀雜質(zhì)

     PEG還能夠在核酸提取過程中沉淀一些雜質(zhì)成分,如細(xì)胞碎片、蛋白質(zhì)等。這些雜質(zhì)成分如果存在于核酸提取物中,會(huì)對(duì)后續(xù)的分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)產(chǎn)生干擾。PEG通過形成高分子凝膠狀物質(zhì),將雜質(zhì)成分包裹并沉淀下來,從而凈化核酸提取物。

三、PEG在核酸提取中的具體應(yīng)用

1、基于磁珠的核酸提取

     在基于磁珠的核酸提取方法中,PEG常作為重要的輔助試劑。具體步驟包括:首先,將待提取的樣本(如血液、組織等)裂解,釋放出核酸分子;然后,加入PEG和高鹽溶液,使核酸分子凝聚并暴露出負(fù)電荷磷酸基團(tuán);接著,加入帶有正電荷基團(tuán)的磁珠,通過離子橋作用將核酸分子吸附在磁珠上;最后,通過磁場(chǎng)作用將磁珠與溶液分離,洗滌磁珠以去除雜質(zhì)成分,最后洗脫磁珠上的核酸分子。

2、無醇清洗液中的應(yīng)用

     在一些無醇清洗液中,PEG也作為重要的成分之一。這些清洗液主要用于去除核酸提取過程中的乙醇?xì)埩艉推渌s質(zhì)成分。PEG通過沉淀作用將雜質(zhì)成分去除,同時(shí)避免了乙醇?xì)埩魧?duì)下游實(shí)驗(yàn)的影響。這種無醇清洗液在xinguan病毒等病原體的核酸提取中得到了廣泛應(yīng)用。

3、片段化DNA的篩選

     在下一代測(cè)序(NGS)等高通量測(cè)序技術(shù)中,需要從樣本中提取特定大小的DNA片段。PEG可以通過調(diào)節(jié)其濃度和反應(yīng)條件,實(shí)現(xiàn)對(duì)不同大小DNA片段的選擇性吸附和純化。具體來說,通過兩輪或多輪吸附過程,可以逐步去除較小或較大的DNA片段,最終得到符合要求的特定大小DNA片段。


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