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柱離心法純化質(zhì)粒DNA

2015-6-25  閱讀(2472)

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實驗原理


1. 離心柱結(jié)構(gòu):特殊硅基質(zhì)吸附材料,特異性吸附DNA,而RNA與蛋白質(zhì)穿過。

在正常情況下,核酸表面覆蓋了一層由水分子組成的親水薄膜,以維持其水溶性。高濃度鹽離子的加入破壞了核酸表面親水薄膜的相對有序排列,形成了疏水環(huán)境。在此環(huán)境中,核酸與硅膠膜能有效結(jié)合,而蛋白質(zhì)、代謝產(chǎn)物和其他污染物則不能結(jié)合。

2. 堿變性抽提的原理是在pH高于12.6的堿性條件下,染色體DNA的氫鍵斷裂,破壞了堿基配對,導(dǎo)致雙螺旋結(jié)構(gòu)解開而變性,但閉環(huán)的質(zhì)粒DNA鏈由于處于拓?fù)淅p繞狀態(tài)而不能彼此分開。當(dāng)pH調(diào)至中性時,質(zhì)粒DNA鏈迅速恢復(fù)到原來構(gòu)型,仍保存于溶液中。而變性的染色體DNA不能再復(fù)性,通過離心,隨不穩(wěn)定的大分子RNA、蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物等一起沉淀下來,使兩者得以分離


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實驗試劑


1. 試劑盒自帶溶液Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ

2. 漂洗液

3. 結(jié)合緩沖液

4. 洗脫緩沖液

5. TE buffer


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實驗設(shè)備


1. 吸附柱

2. 取液槍

3. 離心機(jī)

4. 低壓電泳儀

5. 水平電泳槽

6. 紫外透射儀


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實驗材料


帶有質(zhì)粒的大腸桿菌


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實驗步驟


1. 培養(yǎng)細(xì)菌:將帶有質(zhì)粒的大腸桿菌接種到1.5-3ml含有相應(yīng)抗生素的液體培養(yǎng)基,37℃培養(yǎng)12~16小時;

2. 取液體培養(yǎng)液3ml(1.5mlX2)于Eppendorf管中,10000r/min離心1min,去掉上清液,加入100ml 溶液I,充分混勻;置冰上;

3. 加入150ml 溶液II,加蓋顛倒6-7次使之混勻,冰上放置1-2min;

4. 加入150 m l  溶液III,加蓋后顛倒6-7次混勻,冰上放置5min;

5. 用臺式高速離心機(jī),12000r/min離心10min;

6. 吸附柱中加入420ul 結(jié)合緩沖液,將步驟5中的上清轉(zhuǎn)移至吸附柱中,蓋上收集管的蓋子,混勻, 12000r/min離心1min;

7. 取下吸附柱,倒掉收集管中的液體,吸附柱放回同一收集管,向吸附柱中加入600ul 漂洗液 , 靜置1 min,12000r/min離心30 s;

8. 重復(fù)步驟7一次;

9. 取下吸附柱,倒掉收集管中的液體,吸附柱放回同一收集管,12000r/min離心2min;

10. 吸附柱放入一個新的1.5ML離心管,在吸附柱的中央加40ul洗脫緩沖液或 TE buffer,室溫放置3-5分鐘。蓋好蓋子12000rpm 離心1分鐘,收集質(zhì)粒DNA溶液。

11. 取5ul 電泳檢查,(100ml凝膠加入5ul 染料)。


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注意事項


加樣時要排出槍頭中的空氣,以免攪動液面。

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