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InGex.com是Ingex有限責任公司的所在地，也是TGIRT™-III獨立酶和TGIRT™模板切換RNA-seq試劑盒的*授權銷售商。

TGIRT™ Template-Switching RNA-seq Kit (TGIRTKit25)

試劑盒內(nèi)容：

• 該試劑盒包括該TGIRT ^® -III酶預混合與用于模板切換，二硫蘇糖醇（DTT），修飾的RNA / DNA異源雙鏈寡核苷酸和反應緩沖液進行TGIRT ^®對于Illumina的RNA-SEQ分析模板交換反應。^7,8該試劑盒可以使用無縫連接到cDNA 5'末端的RNA-seq轉(zhuǎn)錄子合成RNA模板的cDNA拷貝。對于RNA-seq文庫構建，在PCR擴增前，必須使用耐熱的5'AppDNA / RNA連接酶（New England BioLabs; M0319S或M0319L）將cDNA第二個RNA-seq 接頭（另購）連接到cDNA的3'末端。

酶性質(zhì)和新型活性：

• 比逆轉(zhuǎn)錄病毒逆轉(zhuǎn)錄酶更高的熱穩(wěn)定性，持續(xù)性和保真度，允許從高度結構化或嚴格修飾的RNA進行全長的端到端cDNA合成。^14,5,6,7,8

• 新的端對端模板切換活動，其能夠在逆轉(zhuǎn)錄過程中連接RNA-seq或PCR適配器，并且不再需要單獨的RNA 3' - 銜接子連接步驟。¹這種模板切換活動大大促進了鏈特異性RNA-seq文庫的構建，其偏倚偏差小于使用隨機六聚體引物的方法，或者使用RNA連接酶進行銜接連接。^1,4,7,8

酶的建議用途：

1. 綜合股特異性轉(zhuǎn)錄組分析。
2. 全細胞，外來體，血漿和其他無細胞RNA的RNA-seq 。
3. miRNA和其他小型非編碼RNA的分析。
4. RIP-seq，HITS-CLIP，CRAC，??核糖體分析。

工具包的優(yōu)點：

1. 綜合轉(zhuǎn)錄組分析比傳統(tǒng)方法更少的偏差。

   根據(jù)zui近的出版物，核糖核酸裂解的片段化通用人參考RNA樣品的TGIRT-seq概括了與非鏈特異性TruSeq v2相比較的人轉(zhuǎn)錄本和尖峰的相對豐度，優(yōu)于鏈特異性Tru-Seq v3。TGIRT®-seq比TruSeq v3顯著更強的鏈特異性，并消除TruSeq固有的隨機六聚體啟動的取樣偏差。TGIRT®-seq顯示更均勻的5'至3'基因覆蓋，并識別比TruSeq更多的剪接點。TGIRT®-seq可以在與結構化小ncRNA（包括tRNA）相同的RNA序列中同時進行mRNA和mRNA的分析，這些tRNA基本上不存在于TruSeq數(shù)據(jù)集中。⁸

2. 全細胞，外來體，血漿和其他細胞外RNA的RNA-seq。

   快速處理時間（通過PCR步驟對RNA-seq文庫構建<5小時）; 需要少量RNA（低ng范圍）; 全面的轉(zhuǎn)錄譜，包括mRNA和lncRNA以及小ncRNA，包括tRNAs，pre-miRNAs和其他結構化小ncRNA的全長讀數(shù); 較常規(guī)方法較少的偏差和較大的鏈特異性。^7,8

3. 比逆轉(zhuǎn)錄病毒RT更高的持續(xù)性和鏈置換活性。

   使得可以獲得tRNA和其他結構化的小ncRNA的全長的端到端cDNA，這些cDNA對于逆轉(zhuǎn)錄病毒RT是難治的。^4-7

4. 通過TGIRT®模板切換的RNA-seq文庫構建，如miRNA分析，RIP-seq，HITS-CLIP，CRAC，??核糖體分析等方法。

   快速處理時間（通過PCR步驟對RNA-seq文庫構建<5小時）; 需要少量RNA（低ng范圍）; 不需要RNA連接酶，通過在該過程中具有較少的步驟，偏倚較小并且更有效。

參考文獻：

1. Mohr，S.，Ghanem，E.，Smith，W.，Sheeter，D.，Qin，Y.，King，O.，Polioudakis，D.，Iyer，VR，Hunicke-Smith，S.Swamy， Kuersten，S.and Lambowitz，AM Thermostable group II intron reverse transcriptase fusion proteins and their use in cDNA synthesis and next generation RNA sequencing。RNA 19，958-970，2013。
2. Collins，K。和Nilsen，T. Enzyme engineering through evolution：熱穩(wěn)定重組II內(nèi)含子逆轉(zhuǎn)錄酶為RNA研究和生物技術提供了新的工具。RNA 19,1017-1018,2013。
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