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二手質(zhì)譜指標，驗收的建議
對于二手質(zhì)譜指標，驗收的建議有幾個是比較重要的：
（1）靈敏度，須在單位質(zhì)量分辨率下
（2）分辨率，須指明在哪個具體的質(zhì)量處
（3）單位質(zhì)量分辨下的m/z范圍
一、關(guān)于m/z范圍
須是單位質(zhì)量分辨以內(nèi)的m/z范圍（m/z范圍跟質(zhì)量分析器有關(guān)）
1、四極桿型
四極桿擅長做什么呢？就是定量！m/z范圍大約在3000～4000 amu，但同時，四極桿對大質(zhì)量數(shù)有歧視，所以，過分強調(diào)m/z范圍沒有特別意義，因為這不是四極桿的擅長。
2、離子阱型
大約在4000（單位質(zhì)量分辨下），有些公司說到6,000，甚至說到20,000 amu，其實也是瞎掰，因為這時分辨率差，m/z 500 和503 都分不開。
離子阱普遍對小質(zhì)量有歧視（1/3效應(yīng)），但對大質(zhì)量（比如1000 amu以上的）反而比四極桿的響應(yīng)好。
3、飛行時間TOF
這是它的強項！單獨的TOF做個十幾萬沒什么問題，但在串聯(lián)了前端的四極桿、離子阱后，二級質(zhì)譜（MS/MS）的m/z范圍就會受到四極桿、離子阱的限制。但如果一定要測定大分子，TOF（或者串聯(lián)TOF）還是遲早要買一臺的。
單從液質(zhì)聯(lián)用來說，能做串聯(lián)質(zhì)譜（tandam mass）是非常重要的，因為液質(zhì)的背景干擾比氣質(zhì)大得多，串聯(lián)質(zhì)譜就是要去除背景。作為前端的質(zhì)量選擇器，大部分都采用四極桿或者離子阱，所以，現(xiàn)在看來，對于液質(zhì)聯(lián)用，m/z范圍就不是一個特別重要的指標。如AB 5500 Qtrap，m/z上限僅做到1000 amu。因為這類儀器，夠用了。
二、分辨率
分辨率好像總是個永遠討論不清的話題。
可參見：有機質(zhì)譜的分辨率
談?wù)動袡C質(zhì)譜的分辨率
需要強調(diào)的是：
1）對于磁質(zhì)譜，我們?nèi)绻f分辨率為10000，比常規(guī)有機質(zhì)譜10000的分辨率，要好很多很多。
2）對于四極桿、離子阱，分辨率用10000表示是不科學的，因為它總在變，所以用FWHM或R=nM表示比較好，因為它在基本m/z范圍內(nèi)是不變的?；蛘?，說明是在哪個質(zhì)量數(shù)下測定的，比如在500 m/z時，分辨率優(yōu)于5000。
3）對于TOF/FT/Orbitrap等，須指明在哪個質(zhì)量數(shù)下面測定的，也用10000、20000 之類的數(shù)字來表示。
三、談掃描速度有沒有用？
掃描速度不是非常重要的一個指標。因為實際獲得一種譜圖，我們考慮的是duty cycle的時間，也就是采集一張譜圖需要多少時間。所以，考察儀器“快"、“慢" 的主要衡量標準，應(yīng)該是duty cycle時間，而不是掃描速度。
掃描速度指的是：把規(guī)定m/z范圍內(nèi)的離子一個一個“掃描"出質(zhì)量分析器的能力，表示為：amu/sec。這僅僅指從分析器出來的一段時間，質(zhì)量分析器不同、工作模式不同，差別就很大。
1、四極桿：
duty cycle時間＝掃描時間＋掃描之間的間隔時間
對于全掃描，比如 掃描m/z 50～550 amu，掃描速度1000 amu/sec，可知道掃描時間為：
500/1000＝0.5秒＝500 毫秒，間隔時間為幾個毫秒，所以，大約每秒可以采集2張全掃描譜圖
對于SIM，比如掃描 m/z 499.5～500.5 amu，掃描速度1000 amu/sec，可知道掃描時間為：
1/1000=0.001秒。間隔時間就比較重要了，為幾個毫秒，所以，用SIM，每秒可采集幾百張譜圖
2、三重四極桿
參見：三重四極桿的掃描速度和譜圖采集速率
3、離子阱
參見：為什么離子阱質(zhì)譜的采集速度不由掃描速度決定？
4、TOF
TOF是非?？斓馁|(zhì)量分析器，如果只求快，不要求分辨率，可以快到每秒采集幾萬張全掃描譜圖。
如果還要求高分辨率，可以每秒采集1～20張全掃描譜圖
就我看來，大家談到TOF，是比較注重用正確的duty cycle時間來表達儀器快、慢的，這是對的。
其它在討論四極桿、離子阱時都不注重
談到四極桿，對定性倒還無所謂，因為轉(zhuǎn)換時間一般都在幾個毫秒量級，比如這兩年，儀器公司已經(jīng)把轉(zhuǎn)換時間從20個毫秒，提高到1毫秒的水平。
但對定量，用duty cycle表示，要科學得多，因為在定量時，分析器的掃描速度用的時間已經(jīng)不是決定duty cycle的時間，MRM通道間的轉(zhuǎn)換時間，已經(jīng)變成了決定時間。
比如：在MRM單位分辨下（即掃描質(zhì)量范圍為1 amu），掃描速度是1000 amu/sec，掃描時間是1/1000＝1 毫秒，如果MRM通道轉(zhuǎn)換時間是20毫秒，那么每秒可采集的譜圖數(shù)是：1000/21=47.6張；
如果MRM通道轉(zhuǎn)換時間是1毫秒，那么每秒可采集的譜圖數(shù)是：1000/2＝500張
將會有數(shù)量級的巨大提升。
再比如談到離子阱，上面引用的講得明白，離子阱duty cycle時間，掃描速度關(guān)系很小，主要是注入離子、穩(wěn)定到阱中的時間。
對離子阱，談掃描速度有多大，沒有啥意思；倒是談?wù)劙褣呙杷俣冉档?，分辨率能到達多高有意思。因為在離子阱里，掃描速度一放慢，分辨率就可以大幅提高，甚至可以分辨0.05 amu的質(zhì)量；
離子阱所謂27,000 amu/sec（或60,000 amu/sec）的掃描速度，不僅對duty cycle 沒什么貢獻，而且沒有人會這么做，因為這時的分辨率差到了3～5個 amu。
四、關(guān)于靈敏度
QUOTE:
靈敏度說“利血平 10pg S/N> 500（RMS） " 中10pg，是說的質(zhì)量么，怎么靈敏度不用濃度來衡量的么。
靈敏度是用信噪比來表示的，S/N，信噪比的計算又有峰-峰比和RMS之分（RMS計算的信噪比一般要比峰-峰比計算的高5～10倍）
RMS是在待測峰周圍，找一段質(zhì)量范圍，然后做均方根平均，作為噪音高度（強度）。再拿待測峰的高度除以平均高度，即為RMS。
我自己想來，儀器廠家一般都傾向于用RMS來表示，因為驗收時各家實驗室的氣體、水、溶劑都不是很確定，所以，用RMS更合理些，可以盡可能地平均掉（消除掉）這種差別。
而峰-峰比，是尋找待測峰周圍一個高的噪音峰，拿待測峰的高度去比上強的那個噪音峰?？赡芩幬餁埩魴z測時要求如何判定時會用到（o（∩_∩）o…，因為這是法規(guī)判定啊，要排除掉任何一種假象）。儀器驗收時，不會做這事，因為即使做，也是一針好一針壞，每個實驗室的結(jié)果都不一樣。
質(zhì)譜的一大特色，就是它是一個質(zhì)量檢測器，峰面積跟質(zhì)量成正比（記得好像UV紫外是濃度型檢測器）。也就是說，我拿1 pg/uL，進樣10 uL；跟拿5 pg/uL，進樣2 uL相比，如果其它條件都一樣，峰面積應(yīng)該是一樣的。
我個人的感覺，從實驗人員來說，稀釋樣品可能比較容易，很容易比較準確；而進樣器的定量環(huán)一般為20 uL，所以進樣10 uL，一定比進樣2 uL來得準確一些。
五、看掃描功能時，主要是：
（1）如果是同一類型儀器，可以幾家不同的廠家比，看差別；看這個差別是不是真的差別（還是只是各個廠家的叫法不同）。
看看這個差別對自己現(xiàn)在和將來的工作是不是有用？有用就再看看，沒用就可以忽略不計。
（2）有些指標是相互沖突的，不同的分析器適用的工作范圍也是不同的。
只是就目前趨勢來講，據(jù)說國際上正在流行一種同時滿足幾項高指標，一次實驗多做幾種掃描的觀點，比如：一次實驗同時定性定量，在高速度時還可以高分辨等等。