APOE小鼠載脂蛋白E(apolipoprotein E，APOE)基因敲除小鼠，也可以稱其為APOE基因缺陷小鼠，是目前研究動脈粥樣硬化（AS）的經(jīng)典模型，除此之外在糖尿病、神經(jīng)退化性疾病和腎臟疾病等方面的研究中也發(fā)揮著重要作用。APOE在健康人體內(nèi)的極低密度脂蛋白（VLDL)中發(fā)現(xiàn)，主要合成場所為肝臟，是一種能夠結合和轉運脂質的特殊蛋白，同時也參與著體內(nèi)總膽固醇（TC）的逆向轉運，是一種多態(tài)性蛋白，可調節(jié)多種生物學功能，而其多態(tài)性與個體血脂水平和動脈粥樣硬化發(fā)生發(fā)展有密切聯(lián)系。

APOE/小鼠模型的優(yōu)點是在正常飼養(yǎng)條件下也可以產(chǎn)生復雜的血管病變，并且這些病變與人類AS病變具有可比性，發(fā)展過程類似于人類Ⅱ型高脂血癥，給予不同配方的高脂飲食可導致不同程度病理變化。5-6周齡APOE基因缺失小鼠在電鏡中可以觀察到大動脈內(nèi)皮細胞表面有單核細胞粘附，并且血漿單核細胞向血管內(nèi)皮遷移，隨著小鼠生長，大多數(shù)的APOE基因缺失小鼠會逐漸自發(fā)形成脂質條紋損傷，進一步發(fā)展可能會形成動脈瘤，老齡APOE 小鼠能模擬人不穩(wěn)定斑塊的特點。

APOE小鼠在動脈粥樣硬化的自噬、凋亡、炎癥及剪切應力等方向的研究均具有重要作用。